Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85AQ96PX6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85AQ96PX6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms