Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRIQ1Q96JM4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
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