Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIRT1Q96EB6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms