Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms