Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APH1AQ96BI3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms