Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKD1Q969G9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms