Protein–RNA interactions for Protein: Q92888

ARHGEF1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1Q92888 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF1Q92888 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF1Q92888 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms