Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC4Q8N9L1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms