Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms