Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNE4Q8N205 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms