Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP2Q8IXW5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms