Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC29A4Q7RTT9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC29A4Q7RTT9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms