Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms