Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CTR9Q6PD62 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms