Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD2Q6P5Q4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms