Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP5Q6NZY7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms