Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3HQ6NTF7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms