Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FRMPD1Q5SYB0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms