Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRY2Q49AN0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms