Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms