Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKPD1Q17RQ9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKPD1Q17RQ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms