Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HIST3H3Q16695 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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