Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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