Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EEA1Q15075 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms