Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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