Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms