Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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