Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
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