Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTAN1Q13813 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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