Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-220ENST00000513252 1063 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-223ENST00000515093 503 ntTSL 48.5□□□□□ -1.052e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-239ENST00000636294 2576 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.052e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-206ENST00000503075 773 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 19
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TARDBPQ13148 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-214ENST00000508610 557 ntTSL 46.62□□□□□ -1.352e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-6■■■□□ 19
TARDBPQ13148 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-6■■■□□ 19
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TARDBPQ13148 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.774e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.054e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.414e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.424e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-214ENST00000556702 520 ntTSL 212.32□□□□□ -0.444e-17■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-213ENST00000556443 585 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.744e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.754e-17■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SUCO-207ENST00000608804 868 ntTSL 36.75□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.592e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.842e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-9■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-9■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-9■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-9■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-7■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 PIAS2-202ENST00000398654 2043 ntTSL 1 (best)23.61■■□□□ 1.378e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 GPR75-ASB3-203ENST00000498475 736 ntTSL 523.51■■□□□ 1.358e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 219.79■□□□□ 0.768e-6■■■□□ 18.9
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TARDBPQ13148 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.728e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 519.57■□□□□ 0.728e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PIAS2-211ENST00000590127 1838 ntTSL 1 (best)19.23■□□□□ 0.678e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.648e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.528e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ARRB1-210ENST00000532525 925 ntTSL 517.99■□□□□ 0.478e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 517.91■□□□□ 0.467e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DOCK8-206ENST00000454469 2087 ntTSL 217.81■□□□□ 0.448e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.437e-11■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 517.71■□□□□ 0.438e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CNOT6-203ENST00000502447 552 ntTSL 317.66■□□□□ 0.428e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.418e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.388e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GPR68-201ENST00000529102 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.368e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.348e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TBC1D13-203ENST00000466056 839 ntTSL 317.02■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 316.96■□□□□ 0.318e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 316.96■□□□□ 0.318e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 DOCK8-212ENST00000479404 595 ntTSL 316.96■□□□□ 0.318e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 516.62■□□□□ 0.258e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ANXA2-229ENST00000560165 718 ntTSL 316.45■□□□□ 0.228e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 GPR68-202ENST00000529300 435 ntTSL 516.41■□□□□ 0.228e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.28e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.198e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 TXNRD2-213ENST00000487165 2020 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.198e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.188e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 416.1■□□□□ 0.178e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.158e-6■■■□□ 18.9
TARDBPQ13148 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.088e-6■■■□□ 18.9
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