Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MKRN3Q13064 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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