Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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