Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TROQ12816 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TROQ12816 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TROQ12816 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TROQ12816 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TROQ12816 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TROQ12816 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TROQ12816 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TROQ12816 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TROQ12816 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TROQ12816 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TROQ12816 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
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