Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3AQ05086 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3AQ05086 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms