Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP7AQ04656 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms