Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPCQ01831 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPCQ01831 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPCQ01831 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms