Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARF3P61204 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms