Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2NP61088 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2NP61088 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms