Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSWP56202 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSWP56202 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSWP56202 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSWP56202 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms