Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA4P51532 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms