Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX2P50458 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX2P50458 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX2P50458 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LHX2P50458 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX2P50458 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms