Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP5C1P36542 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP5C1P36542 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP5C1P36542 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP5C1P36542 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP5C1P36542 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms