Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTSSP25774 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms