Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms