Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA4P12838 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms