Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms