Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF1RP07333 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF1RP07333 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms