Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KA4O75676 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms