Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms