Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms